基因測序“提速” 深圳醫學科研在發力
來源:晶報
發布時間:2021-06-24
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日前,深圳完成了確診阿婆劉某的新冠肺炎基因測序。其結果表明,6月14日、18日、21日新增的四例本土確診病例均屬于Delta變異株,且和CA868國際航班基因測序高度同源。

通過基因測序對病毒溯源,讓專業人員通過序列測定確定病毒的型別,對及時研判疫情、采取有效的防控措施有重要的指導意義。

近日,深圳市疾控中心新冠溯源團隊接受晶報獨家專訪,揭秘新冠病毒基因測序工作中那些不為人知的故事——整個溯源流程包括了樣本的準備、文庫的構建、測序和生物信息學分析等步驟,在接到陽性樣本后,工作人員首先復核工作,對樣本核酸提取,再用兩種試劑進行核酸檢測。復核陽性的核酸,分別進行二代和三代序列測定,為病毒溯源工作設置“雙保險”。

值得一提的是,每個步驟之間都要求工作人員做到“無縫隙連接”。國家對二代測序工作要求的時長是72小時,而在深圳,經過測序團隊對流程的不斷優化,如今,二代測序的結果24小時即可出,抗疫是一個環環相扣的鏈條,基因測序的精準與“提速”,無疑也將為城市的整個抗疫大局贏得寶貴的時間。

而這,也可以說是深圳醫學科研團隊在抗疫過程中展示實力的一個縮影與見證。

早在2020年1月31日,深圳市三醫院研究團隊率先在全國報道了新冠肺炎患者的肛拭子和糞便樣本中檢測到了新型冠狀病毒的核酸。當年3月5日,南方科技大學及深圳市第三人民醫院的合作團隊首次利用冷凍電鏡技術觀測到天然新冠病毒(COVID-19的病原體)經滅活后的成像,讓人們得以看到新冠病毒究竟長什么樣。

2020年5月,英國權威醫學雜志《柳葉刀·傳染病》刊登了一篇聚焦深圳新冠肺炎患者及其密切接觸者的研究報告,肯定了深圳在追蹤密切接觸者及隔離的防控措施對于降低感染率的積極作用。

2020年7月,由深圳市人民醫院手顯微外科團隊撰寫的論文《新型冠狀病毒肺炎中低風險地區手顯微外科診療策略》入選世界衛生組織新型冠狀病毒肺炎(WHO COVID-19)數據庫,該論文成為世衛組織官網關于新型冠狀病毒肺炎的第一批中文文獻,為世界抗疫貢獻了深圳經驗。

今年1月,市三醫院張政教授、清華大學醫學院和萬科公共衛生與健康學院張林琦教授以及清華大學生命科學學院與北京市結構生物學高精尖創新中心王新泉教授合作,在《自然通訊》深度解析人體中和抗體抑制新冠病毒的分子機制,為新冠病毒抗體藥物的開發和疫苗設計提供了理論指導。

從更長的時間軸上來看,近年來,深圳持續在生命醫學研究領域發力。世界上第一個基因治療藥物、第一張亞洲人基因圖譜、國內第一個生物工程一類新藥、第一臺醫用核磁共振診斷儀、第一臺彩色超聲多普勒血液成像系統(彩超)、第一臺伽馬射線治療系統、中國首個抗腫瘤原創化學新藥……一大批生物醫藥自主創新成果先后在深圳誕生。

在這里,我們要再一次向在背后默默付出的市疾控中心新冠溯源團隊致敬。我們也相信,我們不但能戰勝疫情,也終將在阻擊疫情的過程中,讓城市的醫療科研實力再上臺階。

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責任編輯:劉婷

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